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要在微信上注册小程序店铺，可以按照以下步骤进行。
1、打开微信并登录账号，进入微信界面，在右下角找到并点击“发现”，接着选择“小程序”。
2、进入小程序界面，可以通过搜索功能找到“商家助手”，点击进入此小程序，如果之前没有使用过，需要先行注册账号。
3、进入商家助手小程序后，选择“免费开店”，按照引导填写相关信息，需要填写的内容包括但不限于：店铺名称、所属行业、经营类目等，同时需要上传相关的证件资料，如营业执照等，填写完毕后，点击提交。
4、等待审核，审核时间一般为几天到一周不等，审核结果会通过微信消息通知，如果审核通过，就可以开始使用小程序店铺了，如果审核不通过，需要根据提示修改信息并重新提交审核。
5、在审核通过后，可以在商家助手小程序中管理店铺，包括商品上架、订单管理、客户管理等功能，同时也可以通过其他微信平台推广店铺，如公众号、朋友圈等。
需要注意的是，注册小程序店铺需要符合相关的法规和政策要求，比如需要有合法的营业执照等资质，为了提高店铺的曝光率和销售额，还需要注重店铺的运营和推广。
步骤仅供参考，具体流程和所需材料可能因微信更新或地区政策不同而有变化，建议在操作前详细了解相关规定并咨询微信客服。